轉錄組?轉錄組研究的方法有哪些,什麼是轉錄組分析

2023-02-15 13:20:33 字數 3054 閱讀 6112

1樓:匿名使用者

研究主要指具體的研究方法、手段和工具。每一課題都要有相應的研究方法,一般可以採取綜合的方法,或者以一種方法為主,其它方法為輔。這樣有利於收集多方面的資訊,可以得到可靠的結論。

下面介紹課題中常用的幾種研究方法。 一、行動研究法 1、行動研究是由社會情境(包括教育情境)的參與者為提高對所從事的社會的或教育實踐的理性認識,為加深對實踐活動及其背景的理解所進行的反思研究。行動研究的核心是自我反思的螺旋式行進過程,包括計劃行動觀察反思幾個步驟 。

2、行動研究有這樣兩個鮮明的特點: (1)以提高行動質量、改進實際工作、解決現實問題為首要目標 。 (2)主要研究人員就是實踐者,強調研究過程與行動相結合, 行動研究法可採 取這些步驟:

a.選擇問題 即對學校在教育、教學上存在的問題進行調查分析,對問題作出歸納、分類,形成一定時期內要通過研究解決的問題。教師從眾多的問題中概括出具有普遍性和研究價值的問題,通過討論和交流,初步形成各年級或各門學科以及各人的主要問題,形成一個時期學校需要重點解決的問題群。

b.理論**即從教育理論中有針對性地選取最合適的內容,為解決篩選出的問題提供理論指導和操作規範,從而保證行動研究的正確性。如有專業人員參與,則專家要根據教師選出的問題,尋找與問題相關的理論,有針對性地向教師介紹,讓教師瞭解與問題相關的教育理論,通過組織教師學習、討論,教師結合自己的教育教學實踐進一步從中選出適合自己需要的教育理論。

c.實施和反思 即教師按照計劃、行動、觀察和反思的順序,創造性地運用自己已經選擇的、有針對性的教育理論,解決具體教育教學問題,改善教育教學工作,並對實踐的結果作出總結和反思。行動研究的目標是在實施和反思這一階段實現的,它是行動研究的關鍵階段。

這一環節需要教師撰寫開展行動研究、總結實踐經驗的**,為繼續開展行動研究提供參考。 二、觀察法 是指研究者通過感官和輔助儀器,有目的、有計劃地對處於自然情境下的客觀事物進行系統感知觀察的一種科學研究方法。 1、觀察法的分類 :

(1)按照觀察的情境條件來分,可以分為自然情境中的觀察與實驗室觀察 ; (2)按觀察者是否直接參與被觀察者所從事的活動,可分為參與式觀察與非參與式觀察 。 (3)按觀察實施的方法,可分為結構式觀察與非結構式觀察。 結構式觀察預設有明確的目標、所要觀察的問題以及大致範圍,有較詳細的觀察計劃、步驟以及合理設計的可控性觀察,能獲得翔實的材料,並能對觀察資料進行定量分析和對比研究。

2、觀察法的步驟: (1)明確觀察的目的和意義(在觀察中要了解什麼,情況,蒐集哪些方面的事實材料),確定觀察物件、時間、地點、內容和方法。 (2)蒐集有關觀察物件的文獻資料,對所要觀察的條件有一個一般的認識。

(3)編制觀察提綱。對觀察內容進行明確分類,並確定觀察的重點。 (4)實施觀察。

該步要做到有計劃、有步驟、全面而系統地觀察。 (5)記錄並收集資料。 (6)分析資料,得出結論。

3、觀察法的記錄 (1)實地筆記,專門記錄觀察者看到和聽到的事實性內容; (2)個人筆記,用來記錄觀察者個人在實地觀察時的感受和想法; (3)方法筆記,記錄觀察者所使用的具體方法及其作用; (4)理論筆記,用於記錄觀察者對觀察資料進行的初步理論分析。 三、調查法 調查法是指在教育過程中研究者憑藉一定的手段或方法對一些教育現象或事實進行考察,通過對收集到的各種事實資料的分析處理,進而得出結論的一種研究方法。 四、文獻法 通過查閱文獻資料瞭解、證明所要研究物件的方法。

2樓:血紅心黑

一般都是二代測序,然後進行分析

什麼是轉錄組分析

3樓:醉意撩人殤

轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的集合的分析。

轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使rna、核糖體rna、轉運rna及非編碼rna;狹義上指所有mrna的集合。

轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dt)進行親和純化的rna聚合酶ii轉錄生成的成熟mrna和ncrna進行高通量測序。

相對於傳統的晶片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化訊號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍,是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。

4樓:黑石礁畔

轉錄組是指某個物種或特定細胞在某一生理功能狀態下,細胞內所有轉錄的mrna產物的集合,包含了時間和空間的限定,是連線基因組遺傳資訊與生物功能的蛋白質組的必然紐帶。轉錄水平的調控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調控方式。

應用高通量技術進行轉錄組測序是一種快捷可靠的獲取轉錄組資訊的方法。mrna的轉錄本表達分析,通過獲得研究物件基因組轉錄區域的資訊,鑑定轉錄發生位點,可變剪下等,其精確的計數方法更可對基因進行精確的定量分析。

5樓:七叔之家

轉錄組分析包括,編碼基因的分析,翻譯蛋白的**,外顯子內含子的剪下拼接,轉錄本的結構分析功能分析,二級結構等等,或者基因的差異表達

轉錄組最常見的幾個問題

6樓:匿名使用者

轉錄組是指某個物種或特定細胞在某一生理功能狀態下,細胞內所有轉錄的mrna產物的集合,包含了時間和空間的限定,是連線基因組遺傳資訊與生物功能的蛋白質組的必然紐帶。轉錄水平的調控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調控方式。應用高通量技術進行轉錄組測序是一種快捷可靠的獲取轉錄組資訊的方法。

mrna的轉錄本表達分析,通過獲得研究物件基因組轉錄區域的資訊,鑑定轉錄發生位點,可變剪下等,其精確的計數方法更可對基因進行精確的定量分析。

轉錄組測序流程步驟是哪些?

轉錄組測序可以應用到哪些研究領域上

7樓:迷途崽崽

轉錄組所代表的是細胞或組織內全部rna轉錄本(rna transcripts),它反映著不同的生命階段、不同的組織型別、不同的生理狀態以及不同的環境條件下表達的基因。轉錄組的研究可以從整體水平上反映出細胞中基因的表達情況及其調控規律。隨著基因組時代的到來,轉錄組測序技術將會在較為廣泛的領域中得以應用並快速發展。

本文參考近幾年發表的有關轉錄組研究的文獻,綜述了轉錄組測序技術在各研究領域中的應用及取得的成果,並對該技術在核桃研究中的應用進行了展望。

轉錄組測序得到的完整cds區可信嗎

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