cpg島甲基化表型是什麼意思,CPG島甲基化表型是什麼意思

2021-03-20 02:03:57 字數 2451 閱讀 4379

1樓:匿名使用者

背景與目的:cpg島甲基化表型(cpgislandmethylatorphenotype,cimp)涉及到多個基因啟動子同時甲基化,具有腫瘤特異性,與多種腫瘤的發生或預後相關,但有關肝癌cpg島甲基化表型的研究罕見報道。opcml(opioid-bindingprotein/celladhesionmolecule-like)基因目前多為針對上皮性卵巢癌的研究,被認為是卵巢癌的候選抑癌基因。

本研究旨在**cimp及opcml基因與肝癌的發生是否有關。方法:運用甲基化特異性pcr方法檢測50例肝細胞癌組織及48例癌旁組織中opcml、p15、socs-1、gst-p、rar-b、p16、p73、p14、mgmt和hmlh1基因的甲基化狀況。

結果:肝癌組織甲基化率普遍比相應癌旁組織甲基化率高:opcml(70.

0%vs.64.6%)、p15(58.

0%vs.50.0%)、socs-1(78.

0%vs.50.0%)、gst-p(56.

0%vs.27.1%)、rar-b(30.

0%vs.6.3%)、p16(26.

0%vs.14.6%)、p73(16.

0%vs.0%)、p14(36.0%vs.

27.1%)、mgmt(16.0%vs.

10.4%)和hmlh1(18.0%vs.

4.2%)。socs-1,gst-p,rar-b,p16和p73基因甲基化率在肝癌組與癌旁組差異有顯著性(p0.

05),其它基因兩組之間的甲基化率差異無顯著性。cimp陽性組(同時具有≥3個位點甲基化)**時間較早,1年無瘤生存率為18.2%,而cimp陰性組(具有3個位點甲基化)**時間較晚,1年無瘤生存率為75.

0%(p0.05)。結論:

肝癌中存在著cpg島甲基化表型(cimp),cimp可作為肝癌患者預後判斷的指標之一;opcml基因甲基化可能在肝癌的發生中發揮重要的作用。

cpg是指什麼

2樓:蕢言程夢凡

快速消費品cpg(consumer package goods)

cpg島定義問題

3樓:匿名使用者

本來核酸的書寫規則規定在各鹼基之間需要加一個小寫的p作為相鄰兩個核苷酸靠磷酸二酯鍵相連線的標誌,後來大家都喜歡省略掉那個p,也就約定俗成了。

例如,我們一般寫的序列是:tata,而最規範的寫法應該是tpaptpa。

4樓:陳安蓮祭伯

cpg島具有重要的招募轉錄因子的作用,其高甲基化狀態會影響其對轉錄因子的招募,從而降低下游基因的轉錄活性,即影響了基因表達。cpg島是一段富含cg的序列,其甲基化程度可以不同。

5樓:海豚先人

gc島就是真核生物轉錄起始區域的一段富含gc的序列,位於catbox附近,可以調控轉錄的效率。

————————————————————————————————定義為y值大於0.6並且gc含量大於50%的200bp序列區域。只有符合以上標準,才輸入結果。

cpg島經常在脊椎動物基因的5'區域發現,因此,這個程式可用來在基因組序列中查詢潛在的基因。

甲基化測序中cpg o/e值是什麼意思

6樓:蘿蔔蹲兔子蹲

你好連起cg點其c甲基化

覺提問沒意義

建議自查查資料

啟動子區域哪些cpg最易甲基化

7樓:

dna甲基化的生物學作用dna甲基化與遺傳印記、胚胎髮育dna甲基化在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎髮育過程中起著極其重要的作用。研究表明胚胎的正常發育得益於基因組dna適當的甲基化。例如:

缺少任何一種甲基轉移酶對小鼠胚胎的發育都是致死性的。此外,等位基因的抑制(allelic repression)被印記控制區(imprinting control regions, icrs)所調控,該區域在雙親中的一個等位基因是甲基化的。印記基因的異常表達可以引發伴有突變和表型缺陷的多種人類疾病。

2 dna甲基化與腫瘤 甲基化狀態的改變是引起腫瘤的一個重要因素,這種變化包括基因組整體甲基化水平降低和cpg島區域性甲基化水平的異常升高,從而導致基因組的不穩定(如染色體的不穩定、可移動遺傳因子的啟用、原癌基因的表達)和抑癌基因的不表達。如果抑癌基因中有活性的等位基因失活,則發生癌症的機率提高,例如:胰島素樣生長因子-2(igf-2)基因印記丟失導致多種腫瘤,如。

目前腫瘤甲基化的研究主要集中在抑癌基因。這是因為人們發現腫瘤的發生可能與抑癌基因啟動子區的cpg島甲基化造成抑癌基因關閉有關。由於cpg島的區域性高度甲基化早於細胞的惡性增生,因此甲基化的診斷可以用於腫瘤發生的早期**,而且全基因組的低甲基化也隨著腫瘤發生而出現,並且其隨著腫瘤惡性度的增加而顯著,因此甲基化的檢測可用於腫瘤的分級。

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