1樓：匿名使用者
代謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。可以通過全基因組**了編碼基因後，進行pathway資料庫註釋，從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。一般都能找到。
如果找不到，有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。
一般現在的科技服務公司如果做了kegg pathway資料庫註釋的話，都會做代謝通路圖的註釋，可以從結果檔案中的代謝通路圖查詢，找到想要的代謝通路圖後，再分析哪些基因在基因組上存在。
細菌全基因組測序後可否分析到我想要的目的基因？接下來可以進行哪些工作呢？
2樓：35豆豆
測序只是最基礎的，接下來你要做功能基因分析，查詢確定哪一些是編碼基因的序列，然後做表達檢測。。
如果你事先知道自己的目的基因序列，測序結束後，應該可以直接找到。
全基因組測序後怎麼找到我想要的基因的啟動子
3樓：匿名使用者
在基因組中先把你那個基因找出來，看看是在什麼位置，然後拿到這版個基因的上游區權序列（1kb~5kb），這個範圍自己定，然後（1）啟動子資料庫中去找（2）把這部分序列拿去做啟動子**，或者是你有motif的話就更好，**的時候加進去
祝你好運
4樓：匿名使用者
一般的啟動子都有特定的模型，對於全基因組測序而言，只是**而已。每個**啟動子的軟體是基於啟動子模型相關演算法而設計的，但不同的物種其啟動子模型不相同，因此在分析的時候需要進行選擇。
如何查詢一個細菌基因組的全序列
5樓：西蜀子云亭
ncbi，genome資料庫
6樓：勇歡閎新霽
不測序沒法知道基因組大小的。不能體外培養，可以考慮將其插入已知基因組的質粒中培養，再測序。拿到基因組測序圖，後面問題就都解決了。
如何用ncbi查詢某個菌屬下所有菌種的某個基因
簡化基因組測序和基因組測序的區別
7樓：匿名使用者
一、16s測序原理16srdna基因存在於所有細菌的基因組中，具有高度保守性。然而該基因序列還包括9個高變區（v1-v9），通過特異性引物對某一段高變區（如v3區）或某幾段高變區（如v3-v4區）進行擴增測序，然後與資料庫比對，可特異性識別細菌種類。
二、巨集基因組測序原理將基因組dna隨機打斷成若干條500bp的小片段（類似於拼圖中的單個形狀不一的模組），然後連線接頭（雙端120bp），在片段兩端加通用引物進行pcr擴增測序。將reads進行組裝拼接（類似於將眾多模組拼成一副完整**），得到基因序列，眾多基因構成完整的基因集。同時將獲得的reads片段或組裝好的基因序列與ncbi資料庫進行比對，得到物種註釋結果。
對於16s測序而言，任何一個高變區或幾個高變區，儘管變異性再高，對於某些物種來說，這些高變區也可能十分相近，而能夠區分它們的特異性序列片段有可能不在我們的擴增區域內。換言之，非全長的可變區序列覆蓋範圍不夠導致無法鑑定到種。巨集基因組在建庫之前會先將基因組dna隨機打斷成若干小片段，而這些小片段中總有一些能夠包含區分2個物種的基因差異序列。
由於測序深度足夠深，相當於覆蓋了整個基因組的資訊，因此在與ncbi資料庫比對時，就能夠註釋到相應的種水平的物種。
細菌基因組測序完畢後進行基因組註釋需要耗時多久
做全基因來組測序前,自需要檢測dna濃度和純度巨集基因組是指特定環境中全部生物 微生物 遺傳物質的總和。巨集基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以獲得單個樣品的飽和資料量,可進行微生物群體的基因組成及功能註釋,微生物群體的物種分類,多樣性分析,群落結構分析,樣品間的...
個人全基因組重測序需花費多少錢,全基因組測序,有必要做嗎
人類基因組大小 bai3g,重測du序一般需要測定至少20x以上的zhi資料dao 資料乘數高的話對於資訊分析版是權有利的 也就是說一般需要測定60g的資料,如果1g按照5000元算的話,需要30萬元。不過要看你的目的,現在illumina推出的my seq測1個人的好像只需要幾萬。聯合基因有如下產...
全基因組測序怎麼挑選有意義突變
首先需要了解基因組測序的作用與意義 通過基因比對了解物種的進化與變異 分析物種的致病基因。這主要是群體遺傳學與比較基因組學的內容。ncbi提供了不同物種的基因資訊,但提交是否完全?提交完全了是否可靠?顯然即便提交完全也不一定精確,因為不同課題組採用的物種存在地域等多種背景差異,這也是為什麼我國在人類...