1樓:ok嬤嬤嬤哦
即測序所產生的reads在參考基因組比對所佔的比例。比對率越高說明你的資料的利用率越高。一般情況下看參考基因組的情況和測序的質量,一般在70%以上都是可以接受的。
什麼是轉錄組分析
2樓:醉意撩人殤
轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的集合的分析。
轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使rna、核糖體rna、轉運rna及非編碼rna;狹義上指所有mrna的集合。
轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dt)進行親和純化的rna聚合酶ii轉錄生成的成熟mrna和ncrna進行高通量測序。
相對於傳統的晶片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化訊號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍,是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
3樓:黑石礁畔
轉錄組是指某個物種或特定細胞在某一生理功能狀態下,細胞內所有轉錄的mrna產物的集合,包含了時間和空間的限定,是連線基因組遺傳資訊與生物功能的蛋白質組的必然紐帶。轉錄水平的調控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調控方式。
應用高通量技術進行轉錄組測序是一種快捷可靠的獲取轉錄組資訊的方法。mrna的轉錄本表達分析,通過獲得研究物件基因組轉錄區域的資訊,鑑定轉錄發生位點,可變剪下等,其精確的計數方法更可對基因進行精確的定量分析。
4樓:七叔之家
轉錄組分析包括,編碼基因的分析,翻譯蛋白的**,外顯子內含子的剪下拼接,轉錄本的結構分析功能分析,二級結構等等,或者基因的差異表達
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