1樓:紫羅蘭丶花開
過長的測序週期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。
小白求助,華大基因測序結果如何分析
2樓:
目前國際上通用的基因組
de novo
測序方法有三種:
1. 用illumina solexa ga iix測序儀直接測版序;2. 用roche gs flx titanium直接完成全基因組測序;
3.用abi 3730 或權roche gs flx titanium測序,搭建骨架,再用illumina solexa ga iix進行深度測序,完成基因組拼接。
illumina hiseq x ten和2000的測序資料有什麼區別
3樓:健振韋天
不清楚這個易瑞什麼來路,目前的基因檢測主要有2類,一類是通過snp位點(基本上是以snp晶片為手段,也有針對單基因或少數幾個基因位點的使用的是pcr加測序或分型的方式),還有一類是對全基因組進行測序,一般目前採用的是hiseq x-ten測序。
**上第一種如果是幾百萬個snp位點的一般是1000元左右,如果是單基因或少數幾個基因的也就幾十塊錢。第二種全基因組測序的一般測序深度30x以上,90g左右資料,測序費用大概在8000左右,分析snp和indel的變異費用在1000左右。
但是,目前完全不建議做。因為snp的變異與疾病和表型的研究完全不夠充分。單基因的遺傳疾病根本不用測序自己就看出來了,多基因的複雜疾病基因遺傳因素所佔比例有限,只是一個相關概率問題,而且即便知道了也沒什麼手段,早點拿到的資料也是一堆atcg和snp變異和所謂風險值。
還有測序和資料分析費用在飛速下降,目前上萬的全基因組測序同樣的資料可能1年後只用幾百塊,真正有效的解讀也還要等到幾年後,沒必要花這個冤枉錢。
但是以下人群有這個切實需要:腫瘤的突變分型(目前並沒有特別靠譜的高通量測序產品,主要還是基於熒光定量pcr的檢測試劑盒),新生兒的遺傳病篩查(看個人接受程度)
高通量測序 illumina hiseq 2000 和roche454 兩種平臺的區別
4樓:土豆檸檬絲
他們復是兩家不同公司的測序制平臺
1.原理
illumina的hiseq2000和454都是通過單序列的擴增放大訊號,只是hiseq2000中間有橋式擴增,可以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。
2.資料分析和應用方向
資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。
3.通量和**
hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。
綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。
不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。
illumina測序技術術語 lane和run是什麼意思
5樓:匿名使用者
illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次執行專的測序量屬。每張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。
如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。
hiseq測序和miseq測序的區別是什麼
6樓:言吾測序
通量和速度的區別(導致應用方向就不同了),其他一樣。
hiseq的測序通量遠大於miseq,而miseq的測序耗時明顯短於hiseq。
測序原理相同。
illumina最新的試劑(上機測序試劑)有哪些
7樓:匿名使用者
他們是兩
抄家不同公司的測序襲平臺1.原理illumina的hiseq2000和454都是通過bai
單序du列的擴增放大訊號,只zhi是hiseq2000中間有橋式擴增,可dao以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。2.
資料分析和應用方向資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。3.
通量和**hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。
不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。
基因測序的發展前景,基因測序的應用領域
英國倫敦 大學學院和美國羅格斯大學的聯合研究團隊,將基因測序技術和超級版計算機技術相結合權,試圖探索解決這一命題。研究人員把艾滋病 hiv 蛋白酶分子作為物件,酶在不同人體中形狀略有不同,尤其是在蛋白質活動區,在那裡酶完成切片並構成了下一個病毒,進而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形狀,就可以...
有沒有人做過華大基因的無創產前基因檢測
當然有人做過。是不是適合做,要看是檢測什麼樣的專案。很多專案用無創是檢測不了的。有沒有人做過華大基因的無創產前基因檢測啊,準確率高不高的?目前單從 檢測單bai的資料來看是屬於du高zhi危的。但是這項檢測存在很大dao的漏洞,版漏檢率和假陽性率都很高,權因為它主要是通過孕婦的激素水平再結合孕婦的年...
測序後如何分析基因突變,如何根據測序結果判斷基因是否有突變?
基因測序技復 術與目前市場上存在的制基因檢測技術的對比 baidudna 測序技術的優勢 dna 測序技zhi術是人類探知大自然dao和人類自身生命奧祕的基本 所有生物基因組序列的資料,都來自於 dna 測序。這一技術已經發展數十年,無論是技術原理 技術流程 試劑耗材 儀器裝置,還是質量標準,在國際...