1樓:匿名使用者
mrna測序 (rna-seq)
轉錄組學(transcriptomics)是在基因組學後新興的一門學科,即研究特定細胞在內某一功能狀容態下所能轉錄出來的所有rna(包括mrna和非編碼rna)的型別與拷貝數。illumina提供的mrna測序技術可在整個mrna領域進行各種相關研究和新的發現。mrna測序不對引物或探針進行設計,可自由提供關於轉錄的客觀和權威資訊。
研究人員僅需要一次試驗即可快速生成完整的poly-a尾的rna完整序列資訊,並分析基因表達、csnp、全新的轉錄、全新異構體、剪接位點、等位基因特異性表達和罕見轉錄等最全面的轉錄組資訊。簡單的樣品製備和資料分析軟體支援在所有物種中的mrna測序研究。
常規轉錄組測序和數字基因表達譜測序(rna-seq)有什麼不同?初接觸,很多不懂。。 5
2樓:匿名使用者
轉錄組即某個物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的所有rna(包括mrna,**allrna及non-coding rna等)的總和。轉錄組測序是指利用第二代高通量測序技術進行cdna測序,全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本。相對於傳統晶片而言,轉錄組測序無需預先設計探針,即可對任意物種的任意細胞型別的轉錄組進行檢測,能夠提供更精確的數字化訊號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍,是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
基因表達譜指通過構建處於某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cdna文庫,大規模cdna測序,收集cdna序列片段、定性、定量分析其mrna群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度資訊,這樣編製成的資料表就稱為基因表達譜。
3樓:
基本目的是類似的。不同之處在於測序的模板序列,前者是直接隨機測序cdna庫,後者是先把模板按照一定方法打斷(例如酶切或其他),只從打斷位置開始測序,測序片段短,但相應深度更高。
如果你已經有參考基因組,使用所謂「表達譜」測序是可以的。此外,表達譜方法更便宜,但個人覺得適用性不如轉錄組廣泛,可做的分析有限。
如何利用rna測序資料分析基因表達量做熱圖
4樓:
「發現條件間差bai異表達的基因是理解表du型變zhi異的分子基礎的一個有機部分。dao
過去幾十年中,回dna微陣列被廣泛用於定
答量不同基因的mrna丰度,更近期的rna-seq作為一個強有力的競爭者冒了出來。 隨著測序成本持續下降,可以想象使用rna-seq做差異表達分析會。
rna-seq測序,每個樣品2萬元,劃不划算
5樓:匿名使用者
其實測序價bai錢是一方面,du關鍵還是要看測序質量和zhi後期的資料dao分析。華大的現在2g可能
內要27000左右容,4g要42000左右,生物美和這個也差不多的。
目前來說做rna-seq denovo專案的話,要看你研究的物種基因組大小大概有多大,從而看需要的測序量的需求。**要看測序量,分析內容而定,不過一般的denovo在2w以內了~
單細胞測序 rna-seq 哪個更準
6樓:匿名使用者
單細胞測序和rna-seq是應用在不同研究中的兩種測序型別,只看適不適合,沒有那個更準的問題,單細胞測序主要應用在細胞分化、發生、發展、演化過程中的突變等,如癌症的組織差異性,幹細胞的分化、細胞重程式設計及轉分化等過程及相關的基因調節網路等,單細胞測序也有全基因組測序和轉錄組測序兩種;rna-seq主要用於組織或器官等rna的表達情況,如功能基因的表達上調及下調分析,轉錄因子的表達水平等。
國內有沒有rnaseq、二代測序做的好的公司,推薦一個,感覺售後分析都很差?
7樓:輕嘆紅塵
是的,國內做這個實驗的公司挺多,不過服務大多不怎麼樣。可以去上海生因生物版做。我做過兩次,他們的比較權專業。
服務特別好。問題解決的很快。分析上的問題幾乎全部都給你解決。
他們公司免費提供資料上傳geo一類的服務。我之前在別的公司測的,都不提供。我也不會怎麼傳。
他們公司完全不操心,直接上傳好。
什么是單細胞植物，什麼是單細胞植物
就是由單個植物細胞構成，可以自主完成生命活動的細胞，比如單細胞藻類就是！但通常它們是聚集在一起的！只有一個細胞的低等動物,比如草履蟲 單細胞生物 生物可以根據構成的細胞數目分為單細胞生物 protozoa 和多細胞生物 metazoa 單細胞生物只由單個細胞組成，而且經常會聚整合為細胞集落。單細胞生...
單細胞生物都需要有機物作為營養，單細胞生物都需要有機物作為營養對嗎
只要叫生物，都具有生物的各種特徵或者最起碼的特徵 繁殖後代 新陳代謝。而單細胞生物在生態系統中有的是生產者，例如自養型的硝化細菌，以及一些光合作用細菌。大部分是分解者。但是其實還有一些是消費者。比如單細胞的真菌類。綜上，你題目中說單細胞生物都需要以現成的有機物作為營養這句話是不對的。因為自養型的單細...
雞蛋是單細胞動物嗎，雞蛋是單細胞生物嗎？單細胞生物都是微生物嗎。最好是專業的，解釋詳細點。謝謝
一個雞蛋只是一個細胞，也可以說是單細胞，實際上就是一個卵細胞。卵細胞是淡黃那部分，蛋白是輸卵管分泌的蛋白成分。一個細胞，不能叫做動物，所以兩種說法都不科學。天,雖然說基本上是卵細胞最大,但你們見過那麼大的細胞啊?雞蛋是單細胞生物嗎？單細胞生物都是微生物嗎。最好是專業的，解釋詳細點。謝謝 雞蛋是受精卵...