保護鹼基的附表,保護鹼基的新增原則

2023-03-04 09:15:25 字數 1964 閱讀 6779

1樓:小魚愛旅遊世界

在分子克隆實驗中,有時我們會在待擴增的目的基因片段兩端加上特定的酶切位點,用於後續的酶切和連線反應。

由於直接暴露在末端的酶切位點不容易直接被限制性核酸內切酶切開,因此在設計pcr引物時,人為的在酶切位點序列的5端外側新增額外的鹼基序列,即保護鹼基,用來提高將來酶切時的活性。

修飾鹼基:

dna和rna分子中還含有核酸鍊形成後經過修飾形成的其它非主要鹼基。這些鹼基大多是在上述嘌呤或嘧啶鹼的不同部位甲基化(methylation)或進行其它的化學修飾而形成的衍生物。

dna中最常見的修飾鹼基是5-甲基胞嘧啶(m5c)。rna中有許多修飾的鹼基,包括核苷類假尿苷(ψ)、二氫尿苷(d)、肌苷(i)和7-甲基鳥苷(m7g)中含有的鹼基。

2樓:度度

新增保護鹼基,需要考慮兩個因素:一是鹼基數目,一是鹼基種類。

新增保護鹼基時,最關心的應該是保護鹼基的數目,而不是種類。什麼樣的酶切位點,新增幾個保護鹼基,是有資料可以參考的,見附表。

新增什麼保護鹼基,如果嚴格點,是根據兩條引物的tm值和各引物的鹼基分佈及gc含量。如果某條引物tm值偏小,gc%較低,新增時多加g或c,反之亦反。

ecorv如何加保護鹼基

3樓:hey佑沅子

1、 新增保護鹼基,需要考慮兩個因素:一是鹼基數目,一是鹼基種類。

3、 新增什麼保護鹼基,如果嚴格點,是根據兩條引物的 tm 值和各引物的鹼基分佈及 gc 含量。如果某條引物 tm 值偏小,gc%較低,新增時多加 g 或 c,反之亦反。

哪位高手能夠告訴我fermentas最新的酶切保護鹼基表在fermentas官網的**?

4樓:匿名使用者

實際上保護鹼基的個數比保護鹼基的型別重要。因為內切酶在識別的時候,只要個數夠就行了,而不會更加特別的去要求保護鹼基是什麼序列。通常我們都是按照模板序列再多設計幾個鹼基就夠了。

所以現在很少有專門的表來列這個東西,只會給出,至少酶切位點距離末端的距離,也就是保護鹼基的個數(bp from end of dna required for complete digestion)

在參考資料的連結裡面,選 chart: reaction conditions ,就可以看到**中的這一項。當然,如果為了最大限度的保證保護鹼基夠數,做6個基本上不會有任何問題了。

酶切位點保護鹼基中保護鹼基什麼意思指的是什麼

5樓:匿名使用者

如果是pcr裡酶切位點保護鹼基的話,是設計引物時,在設計好了的帶有酶切位點的引物前面在加一段鹼基用來保護引物

6樓:匿名使用者

內切酶在切斷dna時,如果酶切位點在末端時,外側必須還有若干個鹼基內切酶才能發揮作用,外側這幾個鹼基就叫做保護鹼基。不同內切酶保護鹼基個數不同

7樓:

在酶切位點的外側必須多新增幾個鹼基 才能為限制性內切酶提供結合的空間位置

不同的內切酶的保護鹼基不太一樣 一般新增gcg 或 cgc就可以了

8樓:

酶切位點的迴文序列前面可以加幾個特定的鹼基 極大提高酶切效率 每種酶加的不一樣 可以去查一下 大部分酶都是必須加的

保護鹼基怎麼加到引物裡?怎麼確定加入的位置

9樓:

保護鹼基直接加到引物酶切位點的5『端就可以,不同的酶切位點,有不同的保護鹼基。

10樓:華中黃慧敏

保護性鹼基一定加到5『端的,引物上的修飾都是在5』端。

酶切位點加保護鹼基的目的是什麼?

11樓:匿名使用者

保證你可以順利的進行酶切。

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