1樓:匿名使用者
目的基因熒光達到閾值時的迴圈數~ct值越低代表起始模板數量越大~
實時熒光定量pcr資料如何統計?
實時熒光定量pcr的結果該怎樣分析?
2樓:群英鬥將
1、如果有標準曲線,按照標準曲線計算;
2、一般都是相對量,則用delta delta ct方法來計算;
3、引物或探針降解:可通過page電泳檢測其完整性;
4、模板量不足:對未知濃度的樣品應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;
5、看ct值是分析熒光定量pcr最直觀的一個資料,ct值一般在35左右就失去參考價值了,平時我們實驗室用biodai-pcr熒光定量法測得的擴增曲線的起跳值基本在30左右。
擴充套件資料:
pvr的迴圈引數:
1、預變性;
模板dna完全變性與pcr酶的完全啟用對pcr能否成功至關重要,加熱時間參考試劑說明書。
2、變性步驟;
迴圈中一般95℃,30秒足以使各種靶dna序列完全變性,可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不徹底,易造成擴增失敗。
3、引物退火;
退火溫度需要從多方面去決定,一般根據引物的tm值為參考,根據擴增的長度適當下調作為退火溫度。然後在此次實驗基礎上做出預估。退火溫度對pcr的特異性有較大影響。
4、引物延伸;
引物延伸一般在72℃進行(taq酶最適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000bp以上,含pfu及其衍生物的衍生設定為1min/kbp。
5、迴圈數;
大多數pcr含25-35迴圈,過多易產生非特異擴增。
6、最後延伸;
在最後一個迴圈後,反應在72℃維持10-30分鐘.使引物延伸完全,並使單鏈產物退火成雙鏈。
3樓:南京金益柏生物科技****
用2-△△ ct法算的話,應如何算? 假設檢測a基因,ct分別為(這裡記住ct越大,表明相對含量越低) 普通組/test1:28 實驗組1/test2:
29 實驗組2/test3:30 這時候要設對照了,假設test1為對照組(普通組),當然是以普通組為對照 那麼,相對含量為。
4樓:匿名使用者
看ct值、起始拷貝數、標準偏差等
如果是sybr做的話,再看下溶解曲線
實時定量pcr的結果分析
5樓:匿名使用者
sybergreen可以和所有核酸結合,沒有特異性。所以要保證特異性的話,最好用其他的方法。擴增體系中加入模板dna的體積,比如同時10微升的體系,對照組加1微升dna,實驗組加2微升dna,則實驗組的加樣量是對照組的2倍。
看ct值是分析熒光定量pcr最直觀的一個資料,ct值一般在35左右就失去參考價值了,平時我們實驗室用biodai-pcr熒光定量法測得的擴增曲線的起跳值基本在30左右
6樓:藣軙粡膽覓掖付
如果有標準曲線,按照標準曲線計算。一般都是相對量。則用delta delta ct方法來計算。
舉例如下:對照組基因a的ct值為20, 內參(比如βactin)ct值15。實驗組基因a ct值18,內參ct值14。
首先算加樣量:delta ct=15-14=1。2的1次方是2。
也就是說實驗組的加樣量是對照組的2倍。基因a: delta ct=20-18=2。
2的2次方是4。也就是說基因a的量在實驗組是對照組的4倍。但是由於加樣量是2倍,所以4處以2=2,最後的相對量是2倍。
幾點注意: 1。必須確定擴增的特異性 2。
只有相同目標的ct值才能相減(擴增效率有可能不同) 3。 2的某次方只是理論值,實際擴增效率低於2。 4。
最好不用syber green
7樓:邶忠茹胭
pcr是聚合酶鏈式反應,通過反覆的變性退火延伸,達到將微量dna擴增檢測的目的。目前實驗室裡多采用的是實時熒光定量檢測,一起可以讀取每次迴圈的熒光強度,並記錄達到設定的閾值的迴圈次數。原始標本含有的dna量愈多,達到閾值迴圈數愈小。
通過已知濃度的標準品為對照,定量分析樣本所含的目的dna量。
熒光定量pcr檢測時的ct值怎麼確定的
8樓:為青生物
找個教程看看。
先設定基線,機器會自動設定,這個一般不用改。
然後設定閾值,閾值設定的不同,ct值會相差比較大
做熒光定量pcr時,△△ct值是什麼意思,它的計算公式是什麼
9樓:北京索萊寶科技****
△△ct = △ct(試驗樣品) — △ct(基準樣品)△ct(試驗樣品) = ct(試驗樣品,目的基因) — ct(試驗樣品,內參基因)
△ct(基準樣品) = ct(基準樣品,目的基因) — ct(基準樣品,內參基因)
2 -△△ct =2 -(-1.2)= 2.30
熒光定量pcr檢測時的ct值怎麼確定的
10樓:匿名使用者
儀器配套軟體會直接給出來一個ct值,也可自己調節
11樓:匿名使用者
高於背景熒光強度的值被確定為閾值。
ct值: c代表cycle,t代表閾值(threshold),ct值的含義是:每個反迴應管答內的熒光訊號到達設定的閾值時所經歷的迴圈數。
控制在擴增曲線的指數增長階段範圍之內。閾值線與擴增曲線的交叉點確定 ct 值。具體見附圖。
12樓:匿名使用者
根據你初始設定的閾值最後由機器確定的
求助關於熒光定量pcr的ct值問題
13樓:林顧姝
如果有標準曲線,按照標準曲線計算。
一般都是相對量。則用delta delta ct方法來計算。舉例如下:
對照組基因a的ct值為20, 內參(比如βactin)ct值15。實驗組基因a ct值18,內參ct值14。
首先算加樣量:delta ct=15-14=1。2的1次方是2。也就是說實驗組的加樣量是對照組的2倍。
基因a: delta ct=20-18=2。2的2次方是4。也就是說基因a的量在實驗組是對照組的4倍。但是由於加樣量是2倍,所以4處以2=2,最後的相對量是2倍。
幾點注意:
1。必須確定擴增的特異性
2。 只有相同目標的ct值才能相減(擴增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理論值,實際擴增效率低於2。
4。 最好不用syber green
14樓:琦桂花富羅
看了你空間裡的溶解曲線,你可以看到溶解峰的溫度都很低,全在80以下,你擴出來的東西多半隻是引物,你跑定量的時候有做ntc的孔嗎,如果有做,可以對照ntc組和加了模板的組,溶解峰還是一樣的話,那你擴出來的產物100%是引物了。
再有,你的擴增曲線問題,ct太了,一般做定量認為ct=25時,是一個模板擴出來的,所以當大於25擴出來的結果都不可信。
還有,你反轉錄的時候rna加多少,2微克?,反轉錄體系是多少,20微升?反轉錄之後按照多少比例稀釋,1比4?
總之,問題可以再問詳細一點,也可以直接hi我
如果做過ntc那溶解峰就沒問題了,而且都很單一,特異性蠻好的。沒稀釋的cdna做的定量,ct大於30?你p的什麼基因呢,表達量也太低了吧,內參的ct呢,也是這麼低嗎
熒光定量pcr檢測時的ct值怎麼確定的
找個教程看看。先設定基線,機器會自動設定,這個一般不用改。然後設定閾值,閾值設定的不同,ct值會相差比較大 熒光定量pcr檢測時的ct值怎麼確定的 儀器配套軟體會直接給出來一個ct值,也可自己調節 高於背景熒光強度的值被確定為閾值。ct值 c代表cycle,t代表閾值 threshold ct值的含...
實時熒光定量pcr因子表達量越少ct值越小嗎
所謂ct值,就是最先出 現超過閾值訊號的那個迴圈數。或者說是到了第幾個迴圈專才出現超過閾值的訊號。屬 c代表的是cycle,迴圈數目,t代表的是threshold,閾值。所以表達量越少的話,需要越多的迴圈才能擴增出來。也就是ct值越高 表達量越高ct值越小,成反比。pcr ct值越高是否說明表達越低...
用熒光定量pcr的方法進行相對定量其結果的穩定性,可信度如何
定量pcr最好每個樣本有三個重複,每次試驗做三遍比較可靠。因為比較靈敏,有微小差異會影響很大。並且記得檢查每個孔是否有誤差很大的數值,如果有誤差很大的孔建議刪掉這個結果,可能是膜沒有密封好 rt pcr每個樣品做3個平行樣最好 其實2個也可 平行樣之間迴圈數相差在0.2之內較為可靠。結果內中有一個圖...