差異表達基因分析概念篇,兩個基因表達關聯性分析

2023-06-25 05:25:08 字數 1133 閱讀 4562

檢測基因表達水平差異的方法有哪些?

1樓:華源網路

基因的表達是dna-rna-蛋白,期間有轉錄水平調控、轉錄後調控、翻譯後調控等多種調控機制影響該基因的表達。

所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的。蛋白表達多,可能是mrna多,也可能mrna變化不大,而是翻譯多了;蛋白表達少,原因亦然。

從2個水平檢測一個基因的表達,可以更全面地瞭解該基因在該組織某個時期或某種條件下的變化受到什麼水平的調控。

所謂基因表達,就是從dna到mrna再到蛋白的一個過程,基因表達水平一般是通過該基因轉錄的mrna的多少來衡量的。

每個基因轉錄產生的mrna的量,是受到時空等多種因素調控的,個體在不同的生長發育階段,或者不同的組織水平,基因轉錄出mrna的量都是不一樣的。

例如,當某種植物長期生長在高鹽的環境裡,該植物體內與抗鹽相關的基因的表達量就會增加,以適應這種高鹽環境,是植物能夠生存下來,這時植物抗鹽相關的基因表達水平就相對高。

檢測基因表達的方法:

轉錄水平檢測:rt-pcr,real-time pcr,northern blot

翻譯水平檢測:western blot

還有直接檢測,如報告基因、融合熒光蛋白等。

rt-pcr是反轉錄pcr,是半定量方式。real-time pcr可以精確定量。 二者不同。後者為了區別於rt-pcr,一般不縮寫。

生物是很枯燥的呢。

兩個基因表達關聯性分析

2樓:匿名使用者

第一,a的表達產物可能是b的轉錄因子,直接調節b,反之亦有可能;

第二,a的表達產物間接調控b的轉錄,或反之;

實驗設計,首先必須要確定兩者的相關性,不管是正的還是負的,可用wenstern和qpcr的手段;

其次,要從文獻中或訊號轉導通路中挖掘兩者相互關係的可能性;兩之間或許有重要的中介;

再次,找到可能關係後,進一步把中介的重要性闡明,還是找關聯性;

再次,如果是直接的轉錄因子,可以做chip,如果是間接關係,則一定要把中介因子證明清楚,利用文獻,把文獻以外的東西做出來;

最後,利用基因干擾或工具藥物,反過來去證實這種關係的存在;

最最後,能放在整體動物上最好,有表型研究就是大牛。

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